包含有亿万个随机肽段序列的大容量数据库对多种蛋白靶分子是一个丰富的资源库,例如包含细胞因子和生长因子配体、蛋白酶抑制剂和离子门通道。大多数情况下,肽段的配体通过将固定的纯化后的蛋白在噬菌体展示文库里扫描的方法纯化。近有报道表明,甚至更复杂的靶分子,比如完整的细胞和组织也能够通过特异性结合细胞表面抗原来鉴定肽段。通过线性和环形肽段文库可以鉴定出10—20个氨基酸的高亲和性配体。大多数这样的序列和已知一些特定靶蛋白的配体没有相似性。事实上这项技术和其他联合方法都是基于相互作用的本质的。
我们将描述一种多步鉴定受体的高亲和性配体的方法。*步需要建立一个包含随机肽段文库的丝状噬菌体pⅧ展示载体。然后文库再在允许独立相对较弱结合序列的条件下进行扫描, 目的是为了筛选出一个或多个特异性结合靶蛋白的配体家族。然后可以通过亲和性选择展示系统,建立包含有很多先导肽段序列的次级文库。这时可以采取一系列寡核苷酸突变策略,在改变核苷酸的同时固定某些特定的核苷酸基团,或者在各个末端加上任意残基作为受体添加接触点的探针。然后文库被运用于扩充展示高亲和肽段克隆的选择方法,后将获得的克隆通过一种对亲和力敏感的酶联免疫吸收检验,即完成这个过程。
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